Son conceptos diferentes. Endomondo es mas para guardar lo que has hecho y publicarlo luego o guardartelo. Oruxmaps es actualmente el mejor programa de gps para android y permite hacer casi de todo. El ocmo hacerlo... tienes un post dedicado a oruxmaps y en la web de oruxmaps tienes manual de instrucciones. Y si quieres mapas, en mi web tienes todos los mapas de españa para oruxmaps.
Yo tengo ambas aplicaciones y la verdad, me quedo con Endomondo, es la que siempre suelo utilizar. El motivo de mi elección es por la sencillez en el uso y porque el Endomondo tiene su propia página en la que te guarda toda la información relativa a las "salidas deportivas", ya sea en bici, corriendo, andando, o haciendo el pino la2 Además, Endomondo te permite subir a tu teléfono rutas, hechas por tí o por otro usuario, con el fin de visualizarlas en vivo y poder usar la apolicación a "modo de navegación", obviamente no dicta indicaciones, uno mismo tiene que seguir la ruta mirando la pantalla del terminal. En definitiva... mi voto a Endomondo. Pero cada uno tenemos nuestra opinion, prueba las dos aplicaciones y decide tu mismo. ;-) Edito para comentar una cosilla importante que se me olvidaba. Desde la página web de Endomondo pueden conocer cual es tu ubicación exacta, cosa que resulta muy útil cuando sales a pedalear en solitario. En caso de caída con consecuencias chungas... es una muy buena ayuda. No obstante.... prueba, compara y quedate con el que mejor que parezca. Yo, como no ocupa lugar, tengo las dos aplicaciones por si acaso pero como digo.... el 99% de las veces utilizo el Endomondo.