Prueba esto, en los entrenamientos como han dicho por ahí no suele ocurrir porque no hay tensión. No se si lo he entendido bien, pero, si el dolor te viene cuando dejas la bici y te pones a correr, puede venir provocado porque en la bici vas muy tensionado y curvado ¿no?, muy metido en la bici (como todos), esa curvatura y tensión hace que el diafragma se haga pequeño, encoja, y cuando haces la transición y te pones de pie para correr vuelve a hacerse grande, ese cambio tan brusco y rápido hace que te duela la tripa y te quedes sin aire, haciendo muy malos tiempos en competición cuando sabes que lo puedes hacer mejor. Prueba 1km antes de llegar a la transición a ir poniéndote recto hacia arriba y respirar muy hondo, libera tensión, vete relajándote, para que el diafragma vaya tomando poco a poco su forma natural. Pruébalo, a ver que tal.